MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 6453

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015850	CGC	2	6	2693406	2693411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6002	NC_015850	TCCA	2	8	2696158	2696165	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6003	NC_015850	A	6	6	2696169	2696174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_015850	CTGGA	2	10	2696303	2696312	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6005	NC_015850	CTGG	2	8	2696347	2696354	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6006	NC_015850	GCC	2	6	2696396	2696401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6007	NC_015850	CTG	2	6	2696411	2696416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_015850	CAG	2	6	2696423	2696428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_015850	CGC	2	6	2696512	2696517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6010	NC_015850	CCA	2	6	2696531	2696536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_015850	GCC	2	6	2696563	2696568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6012	NC_015850	ACA	2	6	2697627	2697632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_015850	TGT	2	6	2697635	2697640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_015850	AC	3	6	2697708	2697713	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6015	NC_015850	CGCC	2	8	2697728	2697735	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6016	NC_015850	GCC	2	6	2697744	2697749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6017	NC_015850	GC	3	6	2700462	2700467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6018	NC_015850	CG	3	6	2700474	2700479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6019	NC_015850	TG	3	6	2700506	2700511	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_015850	GGA	2	6	2700589	2700594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_015850	GC	3	6	2700681	2700686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6022	NC_015850	TGC	2	6	2700803	2700808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_015850	GCT	2	6	2700819	2700824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_015850	TC	3	6	2700987	2700992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6025	NC_015850	CTG	2	6	2718643	2718648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_015850	AGC	2	6	2718651	2718656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_015850	GCA	3	9	2718684	2718692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_015850	G	7	7	2718695	2718701	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_015850	AGC	2	6	2718707	2718712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6030	NC_015850	GGCC	2	8	2721295	2721302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6031	NC_015850	GAG	2	6	2721310	2721315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_015850	GATAC	2	10	2724244	2724253	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6033	NC_015850	TG	3	6	2725711	2725716	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_015850	ATA	2	6	2726328	2726333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_015850	GGC	3	9	2727142	2727150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_015850	GC	3	6	2727159	2727164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6037	NC_015850	G	6	6	2727184	2727189	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_015850	TCCC	2	8	2727191	2727198	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6039	NC_015850	T	6	6	2727202	2727207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_015850	CGT	2	6	2727275	2727280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_015850	TGC	2	6	2729871	2729876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_015850	CAT	2	6	2733270	2733275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_015850	GTC	2	6	2735679	2735684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_015850	CCGG	2	8	2736765	2736772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6045	NC_015850	A	7	7	2736777	2736783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_015850	AGC	2	6	2736805	2736810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_015850	ACC	2	6	2737406	2737411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6048	NC_015850	CAC	2	6	2737442	2737447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6049	NC_015850	GGC	2	6	2737448	2737453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_015850	CCG	2	6	2737469	2737474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6051	NC_015850	CTTTC	2	10	2737880	2737889	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6052	NC_015850	ACC	2	6	2737998	2738003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6053	NC_015850	GCC	2	6	2738455	2738460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6054	NC_015850	AGACG	2	10	2740761	2740770	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6055	NC_015850	CCAGC	2	10	2740835	2740844	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6056	NC_015850	GAG	2	6	2740946	2740951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_015850	TCC	2	6	2743648	2743653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6058	NC_015850	GAA	2	6	2743726	2743731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_015850	CACC	2	8	2743737	2743744	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6060	NC_015850	GCC	2	6	2743750	2743755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6061	NC_015850	TGA	4	12	2743807	2743818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_015850	GCTC	2	8	2745721	2745728	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6063	NC_015850	ACC	2	6	2745795	2745800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6064	NC_015850	GCC	2	6	2745827	2745832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6065	NC_015850	CGG	2	6	2745944	2745949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_015850	TCA	2	6	2746710	2746715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_015850	TGC	2	6	2746737	2746742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_015850	CCG	2	6	2746743	2746748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6069	NC_015850	CCG	2	6	2750840	2750845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6070	NC_015850	GCA	2	6	2752074	2752079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6072	NC_015850	ACA	2	6	2752122	2752127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_015850	TTTAT	2	10	2752160	2752169	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_015850	T	6	6	2753153	2753158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_015850	GGC	2	6	2754249	2754254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6078	NC_015850	GCCG	2	8	2754343	2754350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6079	NC_015850	GA	3	6	2754770	2754775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_015850	CGGGG	2	10	2755093	2755102	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
6081	NC_015850	CCAG	2	8	2757380	2757387	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6082	NC_015850	GCC	2	6	2757427	2757432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6083	NC_015850	C	6	6	2757431	2757436	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6084	NC_015850	CTC	2	6	2758858	2758863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6085	NC_015850	CGA	2	6	2758916	2758921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_015850	TAT	2	6	2758931	2758936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_015850	CTC	2	6	2759833	2759838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6088	NC_015850	GTG	2	6	2759839	2759844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_015850	GGC	2	6	2759887	2759892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6091	NC_015850	A	7	7	2760349	2760355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_015850	AAG	2	6	2760360	2760365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_015850	GCT	2	6	2760463	2760468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_015850	CGC	2	6	2763389	2763394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6095	NC_015850	GGT	2	6	2764082	2764087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_015850	CGC	2	6	2764098	2764103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6097	NC_015850	GC	3	6	2764123	2764128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6098	NC_015850	TAT	2	6	2766583	2766588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_015850	GTC	2	6	2771334	2771339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_015850	CCT	2	6	2771399	2771404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6101	NC_015850	AGGGG	2	10	2771430	2771439	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
6102	NC_015850	CGC	2	6	2775794	2775799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6103	NC_015850	GC	3	6	2775804	2775809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6104	NC_015850	GA	4	8	2778731	2778738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_015850	G	6	6	2782594	2782599	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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6107	NC_015850	CCAT	2	8	2782705	2782712	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6108	NC_015850	G	6	6	2782726	2782731	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_015850	AGG	2	6	2782803	2782808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6111	NC_015850	TCT	2	6	2782943	2782948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_015850	GGCG	2	8	2782959	2782966	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6113	NC_015850	CCT	2	6	2782968	2782973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6114	NC_015850	G	8	8	2782983	2782990	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_015850	AC	3	6	2783116	2783121	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6116	NC_015850	C	6	6	2784816	2784821	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6117	NC_015850	TGGG	2	8	2784822	2784829	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_015850	GTG	2	6	2784849	2784854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_015850	GCG	2	6	2786253	2786258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6123	NC_015850	CGG	2	6	2786766	2786771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_015850	CTTG	2	8	2786837	2786844	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6125	NC_015850	GAC	2	6	2786863	2786868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_015850	CTC	2	6	2786874	2786879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6127	NC_015850	TTGG	2	8	2786916	2786923	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_015850	TCG	2	6	2788690	2788695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_015850	CAAC	2	8	2788801	2788808	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6130	NC_015850	A	6	6	2788816	2788821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_015850	GCA	2	6	2788843	2788848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6132	NC_015850	CTTT	2	8	2789055	2789062	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6133	NC_015850	ACGC	2	8	2789073	2789080	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6134	NC_015850	GCT	2	6	2789116	2789121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6142	NC_015850	CCGC	2	8	2790379	2790386	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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6393	NC_015850	GCAT	2	8	2898703	2898710	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6396	NC_015850	TGG	3	9	2898898	2898906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6397	NC_015850	CGC	2	6	2898915	2898920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6398	NC_015850	GGGA	2	8	2899040	2899047	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6399	NC_015850	CG	3	6	2899050	2899055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6400	NC_015850	CCG	2	6	2899090	2899095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6401	NC_015850	ACCGCG	2	12	2899106	2899117	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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6404	NC_015850	GTC	2	6	2904563	2904568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6405	NC_015850	GTC	2	6	2904592	2904597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6406	NC_015850	TGC	2	6	2904598	2904603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6407	NC_015850	CCCG	2	8	2904615	2904622	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6408	NC_015850	GAG	2	6	2904627	2904632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6409	NC_015850	GGGC	2	8	2907017	2907024	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6410	NC_015850	GCCACC	2	12	2907071	2907082	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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6412	NC_015850	CAG	2	6	2911339	2911344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6417	NC_015850	G	6	6	2917590	2917595	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6418	NC_015850	CG	3	6	2917611	2917616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6419	NC_015850	GCG	2	6	2918478	2918483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6422	NC_015850	TTCC	2	8	2923251	2923258	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6423	NC_015850	GGCGG	2	10	2923800	2923809	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
6424	NC_015850	AGA	2	6	2924442	2924447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6425	NC_015850	TGGT	2	8	2924467	2924474	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6426	NC_015850	GTC	2	6	2924512	2924517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6427	NC_015850	ATA	2	6	2924548	2924553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6428	NC_015850	TAT	2	6	2924560	2924565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6429	NC_015850	AATA	2	8	2924580	2924587	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6430	NC_015850	G	6	6	2924707	2924712	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6431	NC_015850	GGA	2	6	2924725	2924730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6432	NC_015850	AAG	2	6	2926224	2926229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6434	NC_015850	CGA	2	6	2926272	2926277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6435	NC_015850	CTG	2	6	2926472	2926477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6436	NC_015850	CCA	2	6	2926486	2926491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6437	NC_015850	GAT	2	6	2926502	2926507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6438	NC_015850	GC	3	6	2926518	2926523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6439	NC_015850	GGC	2	6	2926572	2926577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6440	NC_015850	CTC	2	6	2927307	2927312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6441	NC_015850	GCAG	2	8	2930099	2930106	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6442	NC_015850	AGGG	2	8	2930155	2930162	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6443	NC_015850	CGG	2	6	2930938	2930943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6446	NC_015850	TGGG	2	8	2931997	2932004	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6447	NC_015850	CAGC	2	8	2932021	2932028	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6448	NC_015850	GC	3	6	2932027	2932032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6449	NC_015850	GGGT	2	8	2932113	2932120	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6450	NC_015850	C	6	6	2932166	2932171	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6451	NC_015850	CGCGC	2	10	2932173	2932182	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6452	NC_015850	CGGGGT	2	12	2932191	2932202	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6453	NC_015850	ATC	2	6	2932220	2932225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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